瞑想中の眼球運動で、知らず知らずのうちに閉じてた目が半開きになることが多々あります。 しっかりと意識して閉眼した方がいいのでしょうか?

自然と薄っすら開くのであれば大丈夫です。すでに『神の目』ですね!